Wujud upaya mendidik dengan sepenuh hati di SMK Duta Karya Kudus dibuktikan oleh pengurus yayasan bersama seluruh guru di SMK Duta Karya Kudus. Disamping peningkatan mutu SDM dengan mendorong guru untuk studi lanjut S.2 dan S.3 serta diklat-diklat, saat ini SMK Duta Karya Kudus juga telah menyiapkan Pondok Pesantren DUTA ASWAJA sebagai tempat nyantri para siswa / siswi yang berminat untuk meningkatkan kemampuan ilmu agama islam (ulumus syariah). Pesantren yang mulai beroperasional tahun 2016 memiliki fasilitas gedung 3 lantai yang dilengkapi dengan kamar tidur yang representative, kamar mandi dalam, ruang ibadah, ruang diskusi dan belajar, mobil antar jemput dan mini market. Hal ini sangat mendukung kenyamanan dan kelancaran proses KBM di pesantren. Pesantren Duta Aswaja diasuh oleh para pengasuh alumni pondok pesantren salafiyah yang kompeten di bidang ilmu-ilmu agama. Penguasaan Bahasa Inggris dan arab, serta penguatan ahlakul karimah dan amaliah ahlussunnah wal jamaah ann-nahdliyah menjadi prioritas utama proses pendidikan. Hadirnya Pesantren Duta Aswaja sebagai salah satu wujud keseriusan SMK Duta Karya dalam mewujudkan visinya yaitu mencetak lulusan yang Unggul dalam Prestasi, Proffesional dalam Kerja, dan Santun dalam Prilaku.